報告題目：基于深度學習的空間轉錄組注釋方法SPANN
主講人：鄧明華教授（北京大學）
時間：2024年7月12日（周五）16:30 p.m.
地點：北院卓遠樓305會議室
主辦單位：統(tǒng)計與數(shù)學學院
摘要：本報告將介紹課題組最近開發(fā)的空間轉錄組注釋方法SPANN。SPANN的主要任務是將細胞類型標簽從注釋良好的scRNA-seq數(shù)據(jù)轉移到新生成的單細胞分辨率的空間轉錄組數(shù)據(jù),，并從空間數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)新的細胞。 SPANN利用最優(yōu)傳輸理論,，實現(xiàn)了空間轉錄組樣本和 RNA 數(shù)據(jù)原型之間的對齊,，從而進行細胞類型級別的比對。
主講人簡介：
鄧明華,，北京大學數(shù)學科學學院教授,，現(xiàn)任中國商業(yè)統(tǒng)計學會副會長，中國工業(yè)與應用數(shù)學學會數(shù)學建模專委會副主任,，中國現(xiàn)場統(tǒng)計研究會統(tǒng)計交叉分會副理事長,。鄧明華1987年9月-1998年1月在北京大學數(shù)學學院學習，畢業(yè)后留校工作至今,。2003年8月晉升為副教授,，2006年任博士生導師,，2009年8月晉升為教授。其間2001年2月－2003年8月在美國南加州大學計算分子生物學中心從事博士后研究,，2009年8月-2010年1月美國耶魯大學訪問副教授,。鄧明華從事生物信息學研究，發(fā)表SCI論文100余篇,。曾先后主持5項自然科學基金面上項目和1項863項目,，先后參加3項973項目和2項科技部重點研發(fā)項目。
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